Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms