Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ddx28Q9CWT6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ddx28Q9CWT6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx28Q9CWT6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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