Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms