Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930535I16RikQ9CUI2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms