Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms