Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms