Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms