Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpb2Q9CQI7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms