Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms