Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms