Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms