Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms