Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl43Q99N89 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl43Q99N89 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms