Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkd1Q99MH6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms