Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprtQ99M80 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprtQ99M80 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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