Protein–RNA interactions for Protein: Q99L88

Sntb1, Beta-1-syntrophin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb1Q99L88 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sntb1Q99L88 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms