Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms