Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms