Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NgrnQ99KS2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms