Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms