Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms