Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms