Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms