Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms