Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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