Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms