Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhga12Q91XY7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms