Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd3Q91WC0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms