Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms