Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep1Q91W92 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep1Q91W92 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep1Q91W92 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep1Q91W92 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep1Q91W92 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep1Q91W92 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms