Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms