Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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