Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Thoc3Q8VE80 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thoc3Q8VE80 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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