Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc92Q8VDN4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc92Q8VDN4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms