Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms