Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Fam20bQ8VCS3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam20bQ8VCS3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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