Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC74

Cox18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox18Q8VC74 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox18Q8VC74 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox18Q8VC74 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms