Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd109Q8R422 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms