Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd8Q8R3B7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms