Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms