Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Colec12Q8K4Q8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms