Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lin28aQ8K3Y3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms