Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms