Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms