Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp45Q8K387 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp45Q8K387 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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