Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms