Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms