Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scara5Q8K299 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms