Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Neil3Q8K203 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms