Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

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Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc5a11Q8K0E3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a11Q8K0E3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a11Q8K0E3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a11Q8K0E3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a11Q8K0E3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a11Q8K0E3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a11Q8K0E3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a11Q8K0E3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Slc5a11Q8K0E3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc5a11Q8K0E3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc5a11Q8K0E3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc5a11Q8K0E3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a11Q8K0E3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms